共に海洋学者を父に持つ健一とヘレンは父親と一緒に謎の飛行物体が海に降りるところを目撃する4人はボートで現場へ向かったが突然海中からの光線を浴びて見知らぬ場所へと連れ去られてしまうそこは宇宙船の中であった現われた女性は自らをジグラ星人と名乗り自分達の優れた科学力を証明するためと言って彼らの目の前で東京にマグニチュード13の大地震を発生させた未曾有の大災害中ジグラ星人は人類に降伏を要求した海に住むジグラ星人は自分達の星の海を公害で汚してしまったために移住先として美しい海を持つ星を探し480光年離れた地球を見つけたのだと言うジグラは海を占領するだけでなく人類を食料にしようと目論んでいるのだ子供達は宇宙船からなんとか脱出したが彼らを追ってジグラ星人を名乗る女性も上陸した一方ガメラの火炎攻撃を受けた宇宙船は爆発し海中を飛ぶように移動する銀色の怪獣が現われたこれが本当のジグラ星人の姿であった母星との水圧の違いからジグラは見る間に巨大化するガメラは戦いの場をジグラが苦手とする地上に移すが光線の連射を浴びて海中に倒れてしまった身動き一つできないガメラ防衛軍の攻撃ではジグラに対して全く効果がない最後の希望としてガメラを救助に向かった健一達4人も逆にジグラに1万メートルの日本海溝へと引き摺り込まれてしまった4人を人質に取られた防衛軍総司令は遂に降伏を決意した 事実上昭和ガメラシリーズの最終話となる第7作鴨川シーワールドとのタイアップにより海中以外のシーンの大半はシーワールド内のものであるただしジャイガーの時ほど制作費は掛けられなかったため戦闘シーンも海中と海岸に限られ街中のシーンがないのが残念であったストーリーとしては同時期に公開された東宝のゴジラ対ヘドラと同じく海の汚染を大きな柱とし公害の恐ろしさを訴えた作品であるが対ギロンや対ジャオガーと比べて内容に若干まとまりがなく個々の展開も妙にあっさりしている感がある相手の動きを止めることで簡単に宇宙船から脱出できたシーンや4人を人質に取られただけで現場の司令が全人類を代表して簡単にジグラに降伏してしまうところなど当時の子供達でも冗談じゃないと思ったはずであるもっとも子供を人質に取られると人類全部が降伏してしまうのはガメラシリーズの特徴でもあり子供の命は地球より重いを貫いているとも言えるがシリーズの他の作品と比較して特徴的なのはジグラ星人に操られた女性役を演じる八並映子の存在であるビキニで街中を駆け回るシーンは当時の小学生には随分と刺激的であり月面基地で研究にあたる地質学者とは到底思えなかった結果的に最終話となってしまったがそれは制作元の大映の倒産という不測の事態によるものであってこれを作成した時点ではガメラシリーズ自体は続きを作る予定であったため特にシリーズ最終回を彩るものはないこれ以後およそ9年後の宇宙怪獣ガメラまでまたオリジナルと言う点では24年後のガメラ 大怪獣空中決戦までガメラは子供達の前からその勇姿を隠すのであった